Nos amis se retrouvent perdus dans la forêt, soudain, Flora et Skitty se font enlever par un Airmure qui les emmène jusqu'à son nid. Là, Flora rencontre un Bulbizarre. Sacha, Pierre et Max, partent à la poursuite de l'Airmure mais sont arrêtés par d'étranges villageois qui disent que la zone dans laquelle a été amenée Flora est interdite aux humains.
Sacha passe par dessus la muraille qui protége la zone interdite aux humains. Pendant ce temps Flora a des ennuis avec les pokémon plantes de la zone, mais Sacha vient à son aide. Sacha, Pikachu et Flora se retrouvent au bord d'une falaise, face aux pokémon plantes. Soudain un Florizarre apparait et calme les autres pokémon plantes. Le Florizarre est le parent du Bulbizarre rencontré plus tôt par Flora. Bulbizarre part jouer avec Flora et Sacha et leur explique qu'il voudrait sortir de la zone protégée, voyager et découvrir le monde extérieur à la forêt.
La Team Rocket se sert d'un robot géant (surnommé robot-mami) pour capturer tous les pokémon plantes de la forêt, leur robot résiste à l'électricité de Pikachu.
Florizarre affronte le robot avec ses fouets et lianes. Flora dit à tous les pokémon d'utiliser leur attaque Tranche'herbe pour se libérer du robot. Max, Pierre et les villageois rejoingnent Sacha et Flora, et Florizarre achéve le robot avec sa surpuissante attaque Lance-soleil.
Alors que Sacha&co vont partir, Bulbizarre décide de rejoindre Flora et d'abandonner les autres pokémon plantes pour pouvoir découvrir le monde extérieur. Nos héros repartent vers Cimetronnelle avec un nouvel ami.
Sacha, Pierren Flora et Max parcourent la région Hoenn de Lavandia à Nénucrique. Sacha remporte trois nouveaux badges et Flora gagne ses trois premiers rubans.